Home / Gene

BCAR1

This gene is outside the curated CAMIP panel, so it has no curated annotation. Its scored variants from the atlas are listed below.

Scored variants near BCAR1

chr16:75,128,180..75,368,007, gene body plus 100 kb. Showing the strongest 200 by effect size.

VariantPosition PXR FXR AhR AF
chr16_75148880_T_Cchr16:7514888030,9762,59214,336—   
chr16_75148903_G_Cchr16:7514890318,9442,14415,872—   
chr16_75148890_C_Achr16:7514889018,048-14412,288—   
chr16_75148902_A_Tchr16:7514890217,6642,67213,056—   
chr16_75148880_T_Achr16:7514888017,2801,16810,496—   
chr16_75148903_G_Achr16:7514890315,7442,72014,0801.6e-3
chr16_75148846_C_Gchr16:75148846-14,208-768-28,672—   
chr16_75148867_C_Gchr16:75148867-13,504-944-16,1286.6e-6
chr16_75148879_T_Cchr16:7514887912,4164168,448—   
chr16_75148845_G_Tchr16:75148845-12,032-864-10,752—   
chr16_75148851_A_Gchr16:75148851-11,776-2,192-24,832—   
chr16_75148845_G_Achr16:75148845-11,776-848-8,1926.6e-6
chr16_75148817_C_Gchr16:75148817-11,584-1,040-22,528—   
chr16_75148774_C_Gchr16:75148774-11,520-1,104-12,288—   
chr16_75148845_G_Cchr16:75148845-11,200-1,312-13,056—   
chr16_75148827_C_Gchr16:75148827-11,008-1,552-12,288—   
chr16_75148897_T_Gchr16:7514889710,9442,4325,888—   
chr16_75148926_A_Gchr16:75148926-10,944-688-5,3764.0e-5
chr16_75148886_T_Achr16:7514888610,7521,6489,7282.6e-5
chr16_75148843_G_Tchr16:75148843-10,240-816-6,400—   
chr16_75148825_G_Cchr16:75148825-10,176-384-10,240—   
chr16_75148767_C_Tchr16:751487679,8562,84812,032—   
chr16_75148927_G_Tchr16:751489279,7921,3926,9126.6e-6
chr16_75148853_G_Tchr16:751488539,7281,42410,496—   
chr16_75148920_C_Gchr16:75148920-9,664162,048—   
chr16_75148855_C_Gchr16:75148855-9,600-2,432-28,416—   
chr16_75148743_G_Cchr16:751487439,6003,20014,0802.0e-5
chr16_75148851_A_Cchr16:751488519,600-2402,048—   
chr16_75148896_G_Achr16:751488969,53681610,4962.0e-5
chr16_75148762_T_Achr16:75148762-9,536-2,112-8,192—   
chr16_75148849_G_Cchr16:75148849-9,536-416-5,632—   
chr16_75148906_G_Cchr16:751489069,4721,90411,520—   
chr16_75148847_G_Cchr16:75148847-9,408-464-6,912—   
chr16_75148813_C_Gchr16:75148813-9,216-1,536-17,152—   
chr16_75148759_C_Achr16:751487599,0885,44025,088—   
chr16_75148892_C_Achr16:751488928,7682,01614,080—   
chr16_75148848_G_Achr16:75148848-8,768-176-1,536—   
chr16_75148910_C_Gchr16:751489108,7041,92011,520—   
chr16_75148903_G_Tchr16:751489038,7041,5849,7282.0e-5
chr16_75148843_G_Cchr16:75148843-8,512-1,088-9,472—   
chr16_75148726_G_Cchr16:751487268,4481,8886,144—   
chr16_75148847_G_Tchr16:75148847-8,320288256—   
chr16_75148762_T_Gchr16:75148762-8,192-2,288-9,984—   
chr16_75148741_T_Achr16:751487418,0641,55210,240—   
chr16_75148901_G_Cchr16:751489018,0641,1046,656—   
chr16_75148904_A_Gchr16:751489048,0641,5047,680—   
chr16_75148632_G_Cchr16:751486327,8087529,472—   
chr16_75148825_G_Tchr16:75148825-7,680-16-5,632—   
chr16_75148875_A_Gchr16:75148875-7,552-800-5,376—   
chr16_75148905_T_Cchr16:751489057,5529766,912—   
chr16_75148838_T_Gchr16:75148838-7,488-2,776-33,024—   
chr16_75148799_G_Achr16:751487997,4241,3920—   
chr16_75148822_C_Gchr16:75148822-7,360-736-10,4963.3e-5
chr16_75148646_A_Cchr16:751486467,2966886,144—   
chr16_75148848_G_Cchr16:75148848-7,296-496-5,6321.3e-5
chr16_75148904_A_Cchr16:751489047,2327685,120—   
chr16_75148853_G_Achr16:751488537,0401,0089,472—   
chr16_75148727_T_Cchr16:751487277,0401,8724,608—   
chr16_75148825_G_Achr16:75148825-6,976592-5,888—   
chr16_75148766_C_Gchr16:751487666,91273615,872—   
chr16_75148930_C_Achr16:751489306,9127845,376—   
chr16_75148646_A_Tchr16:751486466,7847365,632—   
chr16_75148701_A_Gchr16:751487016,656976-2,048—   
chr16_75148739_C_Gchr16:751487396,6562,0805,376—   
chr16_75148849_G_Tchr16:75148849-6,6564001,280—   
chr16_75148821_G_Cchr16:751488216,528-1924,864—   
chr16_75148821_G_Tchr16:751488216,4002,3685,120—   
chr16_75148844_G_Tchr16:75148844-6,400-624-4,864—   
chr16_75148923_C_Gchr16:751489236,4002086,144—   
chr16_75148852_C_Gchr16:75148852-6,272-960-15,360—   
chr16_75148799_G_Cchr16:75148799-6,272-448-1,280—   
chr16_75148847_G_Achr16:75148847-6,2726241,536—   
chr16_75148901_G_Tchr16:751489016,2721,3765,632—   
chr16_75148836_C_Gchr16:75148836-6,208-512-7,424—   
chr16_75148808_C_Gchr16:75148808-6,208-400-6,400—   
chr16_75148645_T_Cchr16:751486456,1444485,120—   
chr16_75148841_G_Tchr16:75148841-6,144-496-1,280—   
chr16_75148877_G_Tchr16:75148877-6,144-160-5,376—   
chr16_75148823_A_Tchr16:75148823-6,080-400-4,8646.6e-6
chr16_75148785_G_Cchr16:751487856,0162084,096—   
chr16_75148822_C_Tchr16:75148822-5,95280-1,536—   
chr16_75148906_G_Achr16:751489065,8881,55211,520—   
chr16_75148768_T_Achr16:751487685,8885925,376—   
chr16_75148762_T_Cchr16:75148762-5,824-1,696-8,960—   
chr16_75148817_C_Achr16:75148817-5,8245921,280—   
chr16_75148826_C_Achr16:75148826-5,824-32-2,816—   
chr16_75148787_T_Cchr16:75148787-5,760-1,552-14,080—   
chr16_75148707_G_Tchr16:751487075,7601,9529,728—   
chr16_75148726_G_Tchr16:751487265,7601,3763,584—   
chr16_75148844_G_Achr16:75148844-5,760-320-1,280—   
chr16_75148642_A_Gchr16:751486425,6963045,120—   
chr16_75148848_G_Tchr16:75148848-5,696-3042,560—   
chr16_75148813_C_Tchr16:75148813-5,632704-2,0484.6e-5
chr16_75148897_T_Cchr16:751488975,5681,7765,888—   
chr16_75148738_A_Cchr16:751487385,504645,888—   
chr16_75148840_C_Gchr16:75148840-5,440-944-16,3846.6e-6
chr16_75148876_G_Tchr16:75148876-5,376-784-10,752—   
chr16_75148906_G_Tchr16:751489065,2481,53610,240—   
chr16_75148777_C_Gchr16:75148777-5,248-640-6,912—   
chr16_75148900_G_Cchr16:751489005,05651213,568—   
chr16_75148786_T_Gchr16:75148786-4,992-1,696-11,776—   
chr16_75148904_A_Tchr16:751489044,9921,6489,984—   
chr16_75148907_C_Tchr16:751489074,9281,1047,936—   
chr16_75148642_A_Tchr16:751486424,8005126,144—   
chr16_75148933_G_Achr16:751489334,6088487,680—   
chr16_75148646_A_Gchr16:751486464,6082407,424—   
chr16_75148844_G_Cchr16:75148844-4,480-976-9,728—   
chr16_75148826_C_Gchr16:75148826-4,480-640-8,960—   
chr16_75148818_G_Achr16:751488184,4161,42410,240—   
chr16_75148818_G_Tchr16:751488184,4161,0889,984—   
chr16_75148821_G_Achr16:751488214,3528967,424—   
chr16_75148707_G_Cchr16:751487074,3527046,400—   
chr16_75148907_C_Gchr16:751489074,2241,1208,7046.6e-6
chr16_75148858_A_Cchr16:75148858-4,224-976-7,680—   
chr16_75148933_G_Tchr16:751489334,1607527,1682.6e-5
chr16_75148842_G_Cchr16:75148842-4,096-448-5,8883.3e-5
chr16_75148781_C_Gchr16:75148781-3,968-768-6,912—   
chr16_75148905_T_Gchr16:751489053,9688806,912—   
chr16_75148717_C_Gchr16:75148717-3,840-16-7,424—   
chr16_75148892_C_Gchr16:751488923,8409286,9124.6e-5
chr16_75148778_G_Tchr16:751487783,7124,32022,272—   
chr16_75148786_T_Achr16:75148786-3,712-1,984-9,216—   
chr16_75148905_T_Achr16:751489053,7121,0246,912—   
chr16_75148907_C_Achr16:751489073,6489126,912—   
chr16_75148886_T_Gchr16:751488863,5845286,656—   
chr16_75148938_G_Achr16:75148938-3,4562729,472—   
chr16_75148749_T_Achr16:751487493,4561,0887,936—   
chr16_75148830_G_Achr16:751488303,4569926,9126.6e-6
chr16_75148908_G_Cchr16:75148908-3,3928487,9363.4e-3
chr16_75148814_C_Gchr16:751488143,264-1,952-18,176—   
chr16_75148771_G_Tchr16:751487713,0721,88811,008—   
chr16_75148914_G_Tchr16:751489143,0086406,400—   
chr16_75148838_T_Achr16:75148838-2,944-400-7,680—   
chr16_75148863_A_Gchr16:751488632,816-808-10,496—   
chr16_75148702_G_Cchr16:751487022,8169447,424—   
chr16_75148618_C_Gchr16:75148618-2,816-800-6,400—   
chr16_75148899_A_Tchr16:75148899-2,816-1,744-6,400—   
chr16_75148797_T_Gchr16:751487972,816-864-6,144—   
chr16_75148910_C_Achr16:751489102,8165605,888—   
chr16_75148814_C_Achr16:751488142,7528808,704—   
chr16_75148779_T_Gchr16:75148779-2,688-1,440-10,240—   
chr16_75148802_T_Cchr16:75148802-2,688-864-6,912—   
chr16_75148749_T_Gchr16:751487492,6881,0246,656—   
chr16_75148843_G_Achr16:75148843-2,6882565,888—   
chr16_75148884_C_Tchr16:75148884-2,560-80-6,4006.6e-6
chr16_75148768_T_Cchr16:75148768-2,496-560-6,144—   
chr16_75148894_T_Gchr16:751488942,4329449,472—   
chr16_75148923_C_Achr16:751489232,3686406,912—   
chr16_75148808_C_Tchr16:751488082,3047207,6802.0e-5
chr16_75148715_G_Cchr16:75148715-2,304-528-5,888—   
chr16_75148930_C_Tchr16:75148930-2,2407365,888—   
chr16_75148858_A_Gchr16:75148858-2,176-2,272-25,856—   
chr16_75148828_T_Gchr16:75148828-1,920-672-8,704—   
chr16_75148756_C_Gchr16:75148756-1,856-192-5,888—   
chr16_75148787_T_Gchr16:75148787-1,792-1,280-9,728—   
chr16_75148936_C_Achr16:75148936-1,7923366,912—   
chr16_75148809_G_Tchr16:751488091,6641,3606,6562.0e-5
chr16_75148777_C_Achr16:751487771,6648486,144—   
chr16_75148770_A_Cchr16:75148770-1,664-800-5,6322.0e-4
chr16_75148932_C_Achr16:751489321,6007369,216—   
chr16_75148770_A_Gchr16:75148770-1,600-672-6,144—   
chr16_75148894_T_Achr16:751488941,5369447,936—   
chr16_75148894_T_Cchr16:751488941,5369446,6566.6e-6
chr16_75148812_G_Tchr16:75148812-1,4721,0087,168—   
chr16_75148862_A_Gchr16:75148862-1,408-928-14,0807.9e-1
chr16_75148891_T_Achr16:75148891-1,4081,0405,8881.3e-5
chr16_75148714_T_Gchr16:75148714-1,280-464-6,144—   
chr16_75148924_G_Tchr16:751489241,2168167,168—   
chr16_75148931_T_Gchr16:75148931-1,152-816-8,960—   
chr16_75148811_G_Tchr16:75148811-1,1522248,1926.6e-6
chr16_75148711_T_Achr16:75148711-1,02457610,240—   
chr16_75148838_T_Cchr16:751488381,024-528-7,680—   
chr16_75148896_G_Tchr16:75148896960720-6,656—   
chr16_75148810_G_Tchr16:7514881089672012,288—   
chr16_75148823_A_Gchr16:75148823-896-944-8,192—   
chr16_75148842_G_Tchr16:751488428967047,6801.3e-5
chr16_75148671_G_Achr16:751486718963845,888—   
chr16_75148776_G_Achr16:751487767681,9047,424—   
chr16_75148870_C_Gchr16:75148870768-816-7,424—   
chr16_75148790_C_Gchr16:75148790-768-1,088-5,888—   
chr16_75148778_G_Achr16:75148778-6401,6969,216—   
chr16_75148804_T_Gchr16:75148804-576-960-8,960—   
chr16_75148819_G_Tchr16:7514881951265610,496—   
chr16_75148835_A_Gchr16:75148835512-784-7,424—   
chr16_75148820_G_Achr16:75148820-4484967,424—   
chr16_75148895_T_Gchr16:751488953841,20012,0321.3e-5
chr16_75148835_A_Cchr16:75148835384-640-8,960—   
chr16_75148786_T_Cchr16:75148786384-1,232-8,192—   
chr16_75148835_A_Tchr16:75148835-384-432-7,936—   
chr16_75148806_A_Gchr16:75148806-384-816-7,680—   
chr16_75148891_T_Gchr16:751488913846726,656—   
chr16_75148909_C_Achr16:75148909-3848646,400—   
chr16_75148784_G_Tchr16:751487843204486,656—   
chr16_75148775_G_Tchr16:75148775-2561,1686,400—   
chr16_75148920_C_Tchr16:751489202565606,4002.6e-5
chr16_75148802_T_Gchr16:75148802192-1,072-9,984—   
chr16_75148804_T_Cchr16:75148804192-672-5,632—   
chr16_75148895_T_Achr16:751488951281,18412,544—   
chr16_75148895_T_Cchr16:751488951289287,936—   
chr16_75148810_G_Achr16:751488101284806,144—   

Showing 200 of 200 in this window. Scores are the raw center bin Δ, ALT minus REF; click a column to sort.