Home / Gene

HSD17B11

This gene is outside the curated CAMIP panel, so it has no curated annotation. Its scored variants from the atlas are listed below.

Scored variants near HSD17B11

chr4:87,236,515..87,491,188, gene body plus 100 kb. Showing the strongest 200 by effect size.

Variant Position PXR FXR AhR AF
chr4_87278458_A_Tchr4:87278458-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278461_G_Achr4:87278461-1.000-1.000-1.000<0.001%
chr4_87278457_C_Achr4:87278457-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278459_A_Cchr4:87278459-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278461_G_Cchr4:87278461-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278461_G_Tchr4:87278461-1.000-1.000-1.0000.0013%
chr4_87278464_C_Achr4:87278464-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278458_A_Cchr4:87278458-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278457_C_Gchr4:87278457-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278460_A_Cchr4:87278460-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278436_T_Achr4:872784361.0001.0001.000—   
chr4_87278454_G_Cchr4:87278454-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278462_T_Cchr4:87278462-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278457_C_Tchr4:87278457-1.000-1.000-1.000—   
chr4_87278464_C_Gchr4:87278464-0.997-1.000-1.000—   
chr4_87278459_A_Tchr4:87278459-0.982-1.000-1.000—   
chr4_87278464_C_Tchr4:87278464-0.944-1.000-1.000—   
chr4_87278454_G_Achr4:87278454-0.885-1.000-1.000—   
chr4_87278460_A_Tchr4:87278460-0.850-1.000-1.0000.0020%
chr4_87278459_A_Gchr4:87278459-0.825-1.000-1.000—   
chr4_87278436_T_Gchr4:872784360.8171.0000.751—   
chr4_87278473_G_Tchr4:87278473-0.793-1.000-1.000—   
chr4_87278462_T_Achr4:87278462-0.724-1.000-1.000—   
chr4_87278430_A_Tchr4:87278430-0.709-1.000-1.000—   
chr4_87278465_T_Gchr4:872784650.6970.9820.690—   
chr4_87278458_A_Gchr4:87278458-0.655-1.000-0.843—   
chr4_87278463_T_Gchr4:87278463-0.626-0.891-0.745—   
chr4_87278454_G_Tchr4:87278454-0.623-1.000-0.907<0.001%
chr4_87278448_G_Tchr4:87278448-0.602-0.990-0.882—   
chr4_87278456_T_Cchr4:87278456-0.602-1.000-0.818—   
chr4_87278474_A_Tchr4:872784740.5080.6680.293—   
chr4_87278436_T_Cchr4:87278436-0.504-1.000-0.849—   
chr4_87278460_A_Gchr4:87278460-0.498-0.881-0.748—   
chr4_87278446_C_Achr4:87278446-0.475-0.792-0.647—   
chr4_87278463_T_Cchr4:872784630.4740.5510.489—   
chr4_87278455_A_Cchr4:87278455-0.462-0.725-0.513—   
chr4_87278465_T_Achr4:872784650.4500.6570.318—   
chr4_87278474_A_Cchr4:872784740.4500.6440.366—   
chr4_87278398_C_Gchr4:872783980.4430.6160.537—   
chr4_87278473_G_Achr4:87278473-0.403-0.608-0.513—   
chr4_87278456_T_Achr4:87278456-0.396-0.675-0.452—   
chr4_87278411_C_Achr4:87278411-0.391-0.722-0.562—   
chr4_87278470_A_Cchr4:87278470-0.386-0.610-0.531—   
chr4_87278432_G_Achr4:87278432-0.385-0.706-0.544<0.001%
chr4_87278439_G_Tchr4:87278439-0.359-0.509-0.385—   
chr4_87278453_G_Tchr4:87278453-0.357-0.688-0.403—   
chr4_87278439_G_Achr4:87278439-0.354-0.683-0.434—   
chr4_87278443_T_Gchr4:872784430.3440.4030.348—   
chr4_87278450_A_Cchr4:872784500.3380.5320.305—   
chr4_87278451_A_Cchr4:872784510.3330.4960.348—   
chr4_87278475_A_Tchr4:872784750.3320.2210.128—   
chr4_87278399_T_Gchr4:872783990.3280.3950.360—   
chr4_87278434_G_Cchr4:87278434-0.326-0.616-0.495—   
chr4_87278441_T_Gchr4:872784410.3180.5610.299—   
chr4_87278419_A_Gchr4:87278419-0.313-0.486-0.263—   
chr4_87278466_T_Cchr4:872784660.3060.4470.342—   
chr4_87278400_T_Gchr4:872784000.2990.4310.348—   
chr4_87278415_T_Achr4:87278415-0.299-0.587-0.452<0.001%
chr4_87278398_C_Achr4:872783980.2910.3660.342—   
chr4_87278451_A_Gchr4:87278451-0.289-0.452-0.403—   
chr4_87278389_A_Tchr4:872783890.1420.2960.513—   
chr4_87278386_G_Achr4:872783860.2700.5480.507—   
chr4_87279502_A_Gchr4:87279502-0.085-0.322-0.507—   
chr4_87278468_A_Cchr4:87278468-0.281-0.400-0.366—   
chr4_87278473_G_Cchr4:87278473-0.279-0.379-0.434—   
chr4_87278409_C_Tchr4:87278409-0.274-0.488-0.311—   
chr4_87278431_T_Gchr4:87278431-0.272-0.579-0.458—   
chr4_87278437_T_Achr4:87278437-0.268-0.527-0.336—   
chr4_87278438_T_Cchr4:872784380.2670.3400.379—   
chr4_87278447_T_Cchr4:872784470.2670.3820.342—   
chr4_87278452_G_Achr4:87278452-0.258-0.431-0.391—   
chr4_87278416_G_Achr4:872784160.2560.1660.018—   
chr4_87278419_A_Cchr4:872784190.1690.7770.122—   
chr4_87278405_T_Achr4:87278405-0.251-0.392-0.281—   
chr4_87278387_A_Tchr4:872783870.2500.2960.195—   
chr4_87278405_T_Gchr4:87278405-0.250-0.343-0.214—   
chr4_87278367_C_Tchr4:872783670.2480.2570.250—   
chr4_87278389_A_Cchr4:87278389-0.246-0.400-0.220—   
chr4_87278368_C_Gchr4:872783680.2440.1770.165—   
chr4_87278383_T_Achr4:87278383-0.244-0.340-0.354—   
chr4_87278371_C_Achr4:872783710.2430.3430.244—   
chr4_87278407_A_Gchr4:87278407-0.238-0.408-0.318—   
chr4_87278396_T_Gchr4:872783960.2360.4030.287—   
chr4_87278408_A_Tchr4:87278408-0.234-0.494-0.324—   
chr4_87278404_G_Cchr4:87278404-0.232-0.369-0.333—   
chr4_87278432_G_Tchr4:872784320.2310.3820.256—   
chr4_87278456_T_Gchr4:87278456-0.222-0.319-0.220—   
chr4_87278342_A_Gchr4:87278342-0.221-0.156-0.043—   
chr4_87278370_A_Cchr4:87278370-0.221-0.161-0.1770.0020%
chr4_87278368_C_Achr4:872783680.2190.1510.128—   
chr4_87278387_A_Cchr4:872783870.2190.2910.202—   
chr4_87278415_T_Cchr4:87278415-0.217-0.366-0.269—   
chr4_87278403_T_Achr4:87278403-0.215-0.086-0.104—   
chr4_87278406_G_Tchr4:87278406-0.214-0.395-0.281—   
chr4_87278368_C_Tchr4:872783680.2120.1320.147<0.001%
chr4_87278425_G_Tchr4:87278425-0.212-0.203-0.183—   
chr4_87278462_T_Gchr4:872784620.2120.4910.189—   
chr4_87278472_C_Achr4:872784720.2100.3690.171—   
chr4_87278400_T_Cchr4:872784000.2090.2880.202—   
chr4_87278468_A_Gchr4:872784680.2060.3300.311—   
chr4_87278390_A_Gchr4:87278390-0.203-0.190-0.195—   
chr4_87278406_G_Cchr4:87278406-0.203-0.429-0.342—   
chr4_87278408_A_Gchr4:87278408-0.203-0.395-0.238—   
chr4_87278419_A_Tchr4:87278419-0.203-0.216-0.189—   
chr4_87278422_T_Gchr4:872784220.2030.3970.311—   
chr4_87278467_C_Achr4:87278467-0.202-0.210-0.281—   
chr4_87278471_C_Tchr4:87278471-0.200-0.353-0.232—   
chr4_87278450_A_Tchr4:87278450-0.058-0.281-0.354—   
chr4_87278369_C_Tchr4:87278369-0.195-0.029-0.018<0.001%
chr4_87278463_T_Achr4:87278463-0.195-0.242-0.208—   
chr4_87278469_C_Achr4:872784690.1950.4390.238—   
chr4_87278424_T_Gchr4:872784240.1900.3510.324—   
chr4_87278447_T_Achr4:87278447-0.188-0.208-0.293—   
chr4_87278366_T_Cchr4:872783660.1830.0750.043—   
chr4_87278367_C_Gchr4:872783670.1830.1220.110—   
chr4_87278409_C_Gchr4:87278409-0.178-0.273-0.098—   
chr4_87278446_C_Gchr4:87278446-0.178-0.244-0.220—   
chr4_87278435_T_Gchr4:87278435-0.176-0.345-0.287—   
chr4_87278439_G_Cchr4:87278439-0.176-0.101-0.110—   
chr4_87278402_G_Tchr4:872784020.1740.1710.159—   
chr4_87278422_T_Cchr4:87278422-0.174-0.325-0.275<0.001%
chr4_87278383_T_Gchr4:87278383-0.173-0.377-0.281—   
chr4_87278400_T_Achr4:872784000.1710.1270.122—   
chr4_87278397_C_Gchr4:872783970.1680.1920.208—   
chr4_87278339_T_Gchr4:87278339-0.164-0.171-0.049—   
chr4_87278421_C_Achr4:87278421-0.164-0.044-0.037—   
chr4_87278431_T_Cchr4:872784310.1620.2860.140<0.001%
chr4_87278448_G_Cchr4:87278448-0.162-0.270-0.250—   
chr4_87278388_A_Cchr4:87278388-0.132-0.338-0.287—   
chr4_87278402_G_Cchr4:872784020.1610.1790.159—   
chr4_87278367_C_Achr4:872783670.1590.0620.043<0.001%
chr4_87278429_A_Tchr4:87278429-0.159-0.252-0.275—   
chr4_87278395_T_Gchr4:872783950.1570.2260.110—   
chr4_87278428_C_Achr4:87278428-0.157-0.166-0.177—   
chr4_87278444_T_Cchr4:872784440.1570.2700.171—   
chr4_87278467_C_Gchr4:872784670.1570.3400.140—   
chr4_87278409_C_Achr4:87278409-0.156-0.236-0.085<0.001%
chr4_87278396_T_Achr4:872783960.1540.1480.024—   
chr4_87278410_C_Achr4:87278410-0.154-0.306-0.153—   
chr4_87278366_T_Achr4:872783660.1500.0180.006—   
chr4_87278412_A_Gchr4:87278412-0.150-0.031-0.085—   
chr4_87278420_C_Gchr4:87278420-0.150-0.262-0.165—   
chr4_87278366_T_Gchr4:872783660.1490.0000.024—   
chr4_87278434_G_Achr4:87278434-0.130-0.452-0.2320.0039%
chr4_87278434_G_Tchr4:87278434-0.149-0.374-0.177—   
chr4_87278358_A_Tchr4:872783580.1470.018-0.037—   
chr4_87278399_T_Cchr4:872783990.1470.2310.140—   
chr4_87278438_T_Achr4:87278438-0.135-0.242-0.263—   
chr4_87278363_A_Tchr4:872783630.145-0.044-0.018—   
chr4_87278388_A_Gchr4:87278388-0.087-0.218-0.260—   
chr4_87278448_G_Achr4:87278448-0.145-0.234-0.226—   
chr4_87278444_T_Achr4:87278444-0.144-0.132-0.165—   
chr4_87278449_A_Cchr4:872784490.1440.2620.055—   
chr4_87278371_C_Tchr4:87278371-0.142-0.0680.0060.0026%
chr4_87278364_T_Gchr4:872783640.1400.008-0.006—   
chr4_87278418_C_Gchr4:87278418-0.140-0.273-0.226—   
chr4_87278453_G_Cchr4:87278453-0.140-0.330-0.092—   
chr4_87278466_T_Achr4:872784660.1400.1920.134—   
chr4_87278471_C_Gchr4:872784710.1380.3170.195<0.001%
chr4_87278410_C_Gchr4:87278410-0.137-0.345-0.116—   
chr4_87278393_T_Cchr4:87278393-0.1350.039-0.098<0.001%
chr4_87278378_T_Cchr4:872783780.1330.0620.104—   
chr4_87278389_A_Gchr4:87278389-0.133-0.242-0.232—   
chr4_87278392_A_Cchr4:872783920.1320.2700.214—   
chr4_87278397_C_Achr4:872783970.1320.1660.134—   
chr4_87278408_A_Cchr4:872784080.0870.3970.122—   
chr4_87278468_A_Tchr4:872784680.1310.2290.177—   
chr4_87278358_A_Gchr4:872783580.128-0.036-0.043—   
chr4_87278364_T_Achr4:872783640.128-0.031-0.067—   
chr4_87278374_T_Gchr4:872783740.1280.1560.177—   
chr4_87278381_A_Tchr4:87278381-0.128-0.125-0.147—   
chr4_87278452_G_Cchr4:87278452-0.128-0.288-0.220—   
chr4_87278359_G_Cchr4:872783590.0920.1270.226—   
chr4_87278403_T_Cchr4:872784030.1260.1320.122—   
chr4_87278429_A_Cchr4:872784290.1180.3820.220—   
chr4_87278342_A_Tchr4:87278342-0.125-0.062-0.049—   
chr4_87278363_A_Cchr4:872783630.125-0.104-0.079—   
chr4_87278431_T_Achr4:872784310.1250.2080.067—   
chr4_87278440_A_Tchr4:872784400.1030.3790.171—   
chr4_87278386_G_Tchr4:872783860.1230.2260.165—   
chr4_87278418_C_Achr4:87278418-0.121-0.247-0.140—   
chr4_87278455_A_Tchr4:872784550.1210.1900.128—   
chr4_87278371_C_Gchr4:872783710.1200.1580.122—   
chr4_87278393_T_Gchr4:87278393-0.120-0.106-0.128—   
chr4_87278414_A_Tchr4:87278414-0.120-0.242-0.1710.0020%
chr4_87278425_G_Achr4:87278425-0.120-0.255-0.140—   
chr4_87278376_T_Achr4:872783760.1180.1510.171—   
chr4_87278406_G_Achr4:87278406-0.118-0.205-0.165—   
chr4_87278407_A_Tchr4:872784070.1180.0440.043—   
chr4_87278429_A_Gchr4:872784290.1180.1970.085—   
chr4_87278443_T_Cchr4:87278443-0.118-0.203-0.183—   
chr4_87278418_C_Tchr4:87278418-0.080-0.356-0.183—   
chr4_87278363_A_Gchr4:872783630.116-0.078-0.037<0.001%
chr4_87278403_T_Gchr4:872784030.1160.0990.055—   
chr4_87278441_T_Cchr4:872784410.1160.1950.079—   
chr4_87278472_C_Gchr4:872784720.1010.3320.208—   
chr4_87278390_A_Tchr4:87278390-0.115-0.255-0.171—   
chr4_87278358_A_Cchr4:872783580.113-0.081-0.085—   
chr4_87278373_C_Tchr4:87278373-0.113-0.130-0.110—   
chr4_87278382_C_Tchr4:87278382-0.096-0.288-0.202—   

Showing 200 of 200 in this window. Scores are the p99-scaled [−1, 1] value; click a column to sort.