Home / Gene

RABGEF1

This gene is outside the curated CAMIP panel, so it has no curated annotation. Its scored variants from the atlas are listed below.

Scored variants near RABGEF1

chr7:66,554,566..66,911,461, gene body plus 100 kb. Showing the strongest 200 by effect size.

Variant Position PXR FXR AhR AF
chr7_66592108_A_Tchr7:665921080.9740.8861.000—   
chr7_66592190_A_Cchr7:66592190-0.169-0.356-1.000—   
chr7_66592175_A_Cchr7:66592175-0.147-0.226-1.000—   
chr7_66592193_T_Cchr7:66592193-0.132-0.265-1.000—   
chr7_66592170_C_Gchr7:665921700.3660.1691.000—   
chr7_66592203_G_Cchr7:66592203-0.145-0.197-1.000—   
chr7_66592292_T_Cchr7:665922920.6700.2311.000—   
chr7_66592174_A_Cchr7:66592174-0.109-0.182-1.000—   
chr7_66592269_T_Achr7:665922690.2740.2341.000—   
chr7_66592257_C_Gchr7:665922570.2500.1301.000—   
chr7_66592167_T_Cchr7:66592167-0.096-0.125-1.000—   
chr7_66592198_G_Cchr7:66592198-0.111-0.166-1.000—   
chr7_66592092_G_Cchr7:665920920.5880.1640.745—   
chr7_66592152_G_Tchr7:665921520.1400.3191.000—   
chr7_66592212_G_Achr7:665922120.1470.2961.000—   
chr7_66592206_C_Tchr7:665922060.2430.2700.892—   
chr7_66592170_C_Achr7:665921700.1980.1010.867—   
chr7_66592185_G_Cchr7:66592185-0.096-0.195-0.867—   
chr7_66592170_C_Tchr7:665921700.1880.1270.843—   
chr7_66592256_C_Gchr7:665922560.1400.0340.843—   
chr7_66592397_C_Achr7:665923970.4560.5430.696—   
chr7_66592162_A_Cchr7:66592162-0.161-0.247-0.794—   
chr7_66592180_G_Cchr7:66592180-0.010-0.094-0.794—   
chr7_66592195_G_Cchr7:66592195-0.044-0.145-0.757—   
chr7_66592205_T_Cchr7:66592205-0.041-0.239-0.757—   
chr7_66592108_A_Cchr7:665921080.4100.1920.403—   
chr7_66592099_G_Tchr7:66592099-0.0270.2100.721—   
chr7_66592183_C_Achr7:665921830.1130.0620.721—   
chr7_66592255_A_Gchr7:665922550.0530.0230.721—   
chr7_66592161_A_Cchr7:66592161-0.144-0.203-0.708—   
chr7_66592163_C_Tchr7:665921630.0920.1220.708—   
chr7_66592181_G_Cchr7:66592181-0.017-0.158-0.708—   
chr7_66592258_T_Gchr7:665922580.2120.1090.708—   
chr7_66592355_T_Cchr7:66592355-0.075-0.371-0.708—   
chr7_66592092_G_Tchr7:665920920.3760.1380.696—   
chr7_66592171_C_Tchr7:665921710.1680.0730.684—   
chr7_66592165_G_Cchr7:665921650.082-0.160-0.672—   
chr7_66592254_T_Gchr7:665922540.0740.0100.660—   
chr7_66592171_C_Achr7:665921710.1260.0130.635—   
chr7_66592230_C_Achr7:665922300.2820.1660.635—   
chr7_66592256_C_Tchr7:665922560.0720.0210.635—   
chr7_66592255_A_Cchr7:665922550.0380.0000.623—   
chr7_66592071_C_Tchr7:665920710.3420.0830.366—   
chr7_66592172_C_Achr7:665921720.1060.0700.611—   
chr7_66592172_C_Tchr7:665921720.0750.0360.598—   
chr7_66592177_C_Tchr7:665921770.1160.0680.598—   
chr7_66592103_G_Achr7:665921030.3320.0600.134—   
chr7_66592171_C_Gchr7:665921710.1640.1010.586—   
chr7_66592179_C_Achr7:665921790.0410.0700.586—   
chr7_66592286_C_Tchr7:665922860.3280.2290.305—   
chr7_66592177_C_Achr7:665921770.1060.0600.562—   
chr7_66592113_G_Achr7:665921130.3110.0390.513—   
chr7_66592071_C_Gchr7:665920710.3080.0340.134—   
chr7_66592157_G_Tchr7:665921570.0620.1090.550—   
chr7_66592169_C_Tchr7:665921690.1330.0490.550—   
chr7_66592182_C_Tchr7:665921820.0990.0650.550—   
chr7_66592071_C_Achr7:665920710.3010.0420.208—   
chr7_66592169_C_Achr7:665921690.1160.0570.537—   
chr7_66592254_T_Achr7:665922540.0480.0180.537—   
chr7_66592255_A_Tchr7:665922550.0260.0030.537—   
chr7_66592258_T_Achr7:665922580.0800.0340.537—   
chr7_66592173_C_Tchr7:665921730.0960.0470.525—   
chr7_66592257_C_Achr7:665922570.096-0.0080.525—   
chr7_66592082_G_Tchr7:665920820.2910.0960.305—   
chr7_66592178_C_Tchr7:665921780.0440.0650.513—   
chr7_66592200_C_Tchr7:665922000.0890.0650.513—   
chr7_66592282_A_Tchr7:665922820.2870.1270.452—   
chr7_66592172_C_Gchr7:665921720.1090.0340.501—   
chr7_66592177_C_Gchr7:665921770.1060.0600.501—   
chr7_66592179_C_Tchr7:665921790.0750.0550.501—   
chr7_66592200_C_Achr7:665922000.0990.0780.501—   
chr7_66592257_C_Tchr7:665922570.1470.0780.501—   
chr7_66592395_C_Gchr7:665923950.2800.023-0.183—   
chr7_66592179_C_Gchr7:665921790.0580.0490.489—   
chr7_66592192_C_Gchr7:66592192-0.0960.1480.489—   
chr7_66592391_T_Gchr7:665923910.0560.1120.489—   
chr7_66592176_C_Tchr7:665921760.0270.0290.464—   
chr7_66592178_C_Gchr7:665921780.0580.0600.464—   
chr7_66592199_C_Tchr7:665921990.0680.0470.464—   
chr7_66592201_C_Achr7:665922010.0650.0550.464—   
chr7_66592202_C_Tchr7:665922020.0550.0520.464—   
chr7_66592334_A_Tchr7:665923340.0220.2360.464—   
chr7_66592393_C_Tchr7:665923930.2600.026-0.244—   
chr7_66592086_A_Tchr7:665920860.0210.1400.452—   
chr7_66592122_C_Tchr7:66592122-0.0150.1170.452—   
chr7_66592136_C_Achr7:665921360.1610.0650.452—   
chr7_66592145_G_Cchr7:66592145-0.048-0.065-0.452—   
chr7_66592242_C_Achr7:665922420.1110.0750.452—   
chr7_66592256_C_Achr7:665922560.0410.0440.452—   
chr7_66592367_T_Cchr7:665923670.068-0.278-0.452—   
chr7_66592368_C_Tchr7:66592368-0.0530.2780.452—   
chr7_66592103_G_Cchr7:665921030.250-0.0520.073—   
chr7_66592325_C_Gchr7:66592325-0.248-0.0210.012—   
chr7_66592342_A_Cchr7:665923420.2480.0290.085—   
chr7_66592147_G_Tchr7:665921470.0170.1560.440—   
chr7_66592182_C_Gchr7:665921820.0550.0550.440—   
chr7_66592132_C_Gchr7:665921320.1400.1250.427—   
chr7_66592178_C_Achr7:665921780.0170.0230.427—   
chr7_66592196_C_Achr7:665921960.0440.0570.427—   
chr7_66592392_A_Tchr7:665923920.239-0.052-0.061—   
chr7_66592395_C_Achr7:665923950.194-0.062-0.427—   
chr7_66592134_G_Cchr7:665921340.009-0.010-0.415—   
chr7_66592169_C_Gchr7:665921690.1230.0340.415—   
chr7_66592182_C_Achr7:665921820.0720.0360.415—   
chr7_66592202_C_Achr7:665922020.0720.0570.415—   
chr7_66592310_T_Cchr7:665923100.1610.0810.415—   
chr7_66592108_A_Gchr7:665921080.1680.2030.403—   
chr7_66592117_G_Tchr7:66592117-0.048-0.125-0.403—   
chr7_66592173_C_Gchr7:665921730.0720.0100.403—   
chr7_66592358_T_Cchr7:66592358-0.012-0.171-0.403—   
chr7_66592386_C_Achr7:665923860.002-0.068-0.403—   
chr7_66592120_A_Gchr7:665921200.2220.0440.171—   
chr7_66592311_A_Gchr7:66592311-0.221-0.0860.061—   
chr7_66592173_C_Achr7:665921730.0410.0180.391—   
chr7_66592199_C_Achr7:665921990.0850.0490.391—   
chr7_66592199_C_Gchr7:665921990.0620.0470.391—   
chr7_66592314_T_Cchr7:665923140.0800.0470.391—   
chr7_66592393_C_Gchr7:665923930.2140.005-0.073—   
chr7_66592125_C_Achr7:665921250.2120.0470.379—   
chr7_66592129_C_Gchr7:665921290.1470.0550.379—   
chr7_66592166_C_Gchr7:665921660.0170.0130.379—   
chr7_66592168_C_Tchr7:665921680.0750.0520.379—   
chr7_66592073_G_Cchr7:66592073-0.210-0.010-0.134—   
chr7_66592337_G_Cchr7:66592337-0.210-0.052-0.293—   
chr7_66592080_C_Achr7:66592080-0.209-0.0030.159—   
chr7_66592153_C_Tchr7:665921530.0510.0780.366—   
chr7_66592164_C_Achr7:665921640.0480.0620.366—   
chr7_66592188_A_Tchr7:665921880.1060.1090.366—   
chr7_66592200_C_Gchr7:665922000.0550.0680.366—   
chr7_66592365_G_Cchr7:66592365-0.108-0.091-0.366—   
chr7_66592394_G_Cchr7:665923940.118-0.081-0.366—   
chr7_66592396_A_Cchr7:665923960.204-0.096-0.281—   
chr7_66592184_C_Gchr7:665921840.0990.0700.354—   
chr7_66592400_C_Gchr7:665924000.1960.1270.085—   
chr7_66592115_G_Cchr7:665921150.195-0.0130.037—   
chr7_66592344_A_Gchr7:66592344-0.193-0.052-0.122—   
chr7_66592073_G_Tchr7:66592073-0.191-0.031-0.232—   
chr7_66592075_C_Gchr7:66592075-0.1620.003-0.342—   
chr7_66592080_C_Gchr7:66592080-0.1910.000-0.134—   
chr7_66592138_C_Tchr7:665921380.0990.0570.342—   
chr7_66592150_C_Tchr7:665921500.0120.0700.342—   
chr7_66592176_C_Achr7:665921760.0380.0310.342—   
chr7_66592183_C_Tchr7:665921830.0480.0520.342—   
chr7_66592197_C_Tchr7:665921970.0720.0470.342—   
chr7_66592371_G_Cchr7:66592371-0.159-0.200-0.342—   
chr7_66592072_A_Gchr7:665920720.014-0.075-0.330—   
chr7_66592101_A_Tchr7:665921010.1810.2030.330—   
chr7_66592176_C_Gchr7:665921760.0240.0260.330—   
chr7_66592184_C_Tchr7:665921840.0340.0520.330—   
chr7_66592201_C_Tchr7:665922010.0410.0290.330—   
chr7_66592339_C_Gchr7:66592339-0.0430.0940.330—   
chr7_66592379_C_Gchr7:665923790.1420.0360.330—   
chr7_66592151_G_Cchr7:66592151-0.044-0.103-0.318—   
chr7_66592207_C_Gchr7:665922070.0480.0360.318—   
chr7_66592388_C_Gchr7:665923880.1780.1120.073—   
chr7_66592396_A_Tchr7:665923960.178-0.086-0.208—   
chr7_66592113_G_Tchr7:665921130.174-0.0160.024—   
chr7_66592194_C_Gchr7:665921940.1740.0390.049—   
chr7_66592139_C_Achr7:665921390.1130.0360.305—   
chr7_66592149_A_Cchr7:665921490.014-0.044-0.305—   
chr7_66592158_A_Cchr7:66592158-0.031-0.065-0.305—   
chr7_66592196_C_Tchr7:665921960.0440.0340.305—   
chr7_66592201_C_Gchr7:665922010.0620.0340.305—   
chr7_66592206_C_Gchr7:665922060.0390.0360.305—   
chr7_66592207_C_Achr7:665922070.0030.0390.305—   
chr7_66592258_T_Cchr7:665922580.0510.0390.305—   
chr7_66592303_G_Achr7:665923030.0440.0810.305—   
chr7_66592317_C_Achr7:665923170.1710.0880.171—   
chr7_66592372_G_Cchr7:66592372-0.171-0.096-0.305—   
chr7_66592389_G_Tchr7:66592389-0.005-0.078-0.305—   
chr7_66592074_G_Achr7:66592074-0.169-0.013-0.171—   
chr7_66592073_G_Achr7:66592073-0.1680.000-0.159—   
chr7_66592093_A_Cchr7:66592093-0.168-0.0100.012—   
chr7_66592389_G_Cchr7:665923890.1680.075-0.085—   
chr7_66592143_G_Achr7:66592143-0.166-0.0080.220—   
chr7_66592377_G_Cchr7:66592377-0.166-0.055-0.085—   
chr7_66592100_G_Achr7:665921000.0890.0390.293—   
chr7_66592111_G_Cchr7:665921110.1040.0780.293—   
chr7_66592139_C_Tchr7:665921390.0850.0340.293—   
chr7_66592183_C_Gchr7:665921830.0440.0490.293—   
chr7_66592232_T_Achr7:665922320.1260.0490.293—   
chr7_66592253_G_Tchr7:66592253-0.079-0.029-0.293—   
chr7_66592284_A_Gchr7:665922840.0990.0420.293—   
chr7_66592313_G_Cchr7:665923130.1640.0570.134—   
chr7_66592397_C_Gchr7:665923970.162-0.003-0.098—   
chr7_66592082_G_Achr7:665920820.1610.0440.147—   
chr7_66592100_G_Tchr7:665921000.0750.0260.281—   
chr7_66592133_C_Tchr7:665921330.0440.0180.281—   
chr7_66592136_C_Gchr7:665921360.0990.0130.281—   
chr7_66592164_C_Gchr7:665921640.0580.0750.281—   
chr7_66592187_G_Cchr7:665921870.1030.0390.281—   
chr7_66592197_C_Gchr7:665921970.0270.0470.281—   
chr7_66592225_C_Achr7:66592225-0.116-0.130-0.281—   
chr7_66592296_C_Achr7:665922960.0550.0390.281—   
chr7_66592297_C_Tchr7:665922970.1030.0750.281—   
chr7_66592302_C_Gchr7:66592302-0.017-0.0130.281—   
chr7_66592313_G_Tchr7:665923130.1570.0810.232—   
chr7_66592365_G_Tchr7:66592365-0.157-0.029-0.085—   
chr7_66592382_A_Gchr7:66592382-0.157-0.1120.012—   
chr7_66592393_C_Achr7:665923930.1420.018-0.281—   

Showing 200 of 200 in this window. Scores are the p99-scaled [−1, 1] value; click a column to sort.